月经干净以后腰疼，可能是正常生理现象，也可能是盆腔炎、宫颈炎、子宫内膜炎、子宫肌瘤等原因导致的。

1、正常生理现象

月经期间女性子宫内膜会出现脱落，从而会导致子宫内膜出现充血的情况，而且月经期间身体比较虚弱，如果过度劳累或者是做剧烈运动，可能会导致腰部的肌肉出现痉挛，从而引发腰疼。一般不需要特殊治疗，建议患者注意休息，避免过度劳累。

2、盆腔炎

如果患者平时不注意个人卫生，可能会导致细菌通过宫颈口进入到盆腔内，从而诱发盆腔炎，炎症刺激会导致盆腔充血，引起腰腹部疼痛，还会伴有阴道分泌物增多、异常阴道出血等症状。患者可遵医嘱服用抗生素药物治疗，如盐酸左氧氟沙星胶囊、阿莫西林胶囊等。

3、宫颈炎

宫颈炎是指宫颈阴道部及宫颈管黏膜的炎症，可能是阴道炎蔓延导致的，会使宫颈部位出现炎症反应，导致宫颈部位的黏膜受损，出现腰腹部酸痛、阴道分泌物增多、阴道不规则出血等症状。患者可在医生指导下口服抗宫炎片、宫炎平片等药物治疗。

4、子宫内膜炎

子宫内膜炎是指细菌突破宫颈的防御侵入子宫内膜而发生炎症，可能会出现盆腔区域不适、异常阴道分泌物、月经异常等症状。患者可遵医嘱口服盐酸左氧氟沙星胶囊、阿奇霉素胶囊等药物治疗。

5、子宫肌瘤

子宫肌瘤是子宫平滑肌组织增生形成的良性肿瘤，可能与遗传因素、激素水平异常等因素有关，患者可能会出现月经异常、腹部肿块、腰疼等症状。建议患者可以在医生的指导下使用米非司酮片、氨甲环酸片等药物辅助改善。如果药物得不到改善，可以在医院通过肌瘤切除术、子宫切除术等手术方式进行治疗。

另外，建议患者及时去医院就医，明确疾病，对因治疗，以免延误病情。